权利人实际损失的计算：实践中权利人主张实际损失，主要依据自身的研发成本、减少的订单数量×平均利润等。直接依据技术秘密研发成本主张实际损失，一般难以得到支持。权利人实际损失，实际上是指权利人预期收益数额，即若无被告的侵权行为，原告本可获得的利润。如原告无证据###其因被告侵权行为而失去的订单数量，一般可推定侵权行为人新增订单源自权利人因侵权行为失去的订单，权利人可依据侵权行为人订单数量和行业平均利润主张赔偿额。如果证据确凿可信，甚至可依据权利人的利润率确定。但对权利人的举证水平有较高要求，对于销售数量、价格、利润率等均须有比较明确、直接的证据。
这种计算方式存在有两个问题：一是减少的订单数量与市场需求直接相关，涉及的影响因素很多，有时订单不但没有减少，反而还有增加，也就是说权利人的收益增加了；二是平均利润，权利人主张的平均利润与侵权人获利中的平均利润，往往存在有很大差距。
侵权人侵权获利的计算：从司法实践看，###实际损失难度较高，以侵权获利来确定赔偿数额相对容易，因侵权获利证据相对而言较易获得，如：侵权产品销售量×行业平均利润率。鉴于目前我国许多中小企业会计管理制度不完善，权利人要想获取相关的财务数据，困难很大。###侵权获利还需要###涉案商业秘密在企业经营获利中贡献率的相应证据。因侵权人的利润有多种来源，一般难以认定侵权人经营所获利润都来源于争议的商业秘密。
这种计算方式面临的问题：一是能否获取完整的侵权人会计管理数据，成为评估侵权人侵权获利的关键；二是侵权人获利来源与争议的商业秘密是否有直接关系。
法官的法定赔偿：由于举证的问题，当前多数商业秘密侵权案/件运用法定赔偿方法确定赔偿数额，同时，在一定程度上导致赔偿数额偏低。司法实践中，如果权利人能够提供其实际损失，或被告侵权获利的证据，至少可以据此计算出销售额或利润总额等的基本数字，使后续的酌定有所依据，可以为法.院在法定限额赔偿中参考。在商业秘密刑.事保护中，需要对侵.犯商业秘密的侵权行为给权利人造成的经济损失，或者侵权人的获利进行评估。只有当权利人的经济损失，或者侵权人的获利超过50万元，才有可能构成刑.事案/件。因此，公.安机关在办理商业秘密刑.事案/件时，对证据的收集就显得尤其重要。
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